L'Ireps participe activement aux politiques régionales mises en place dans le champ de la santé publique, notamment le Schéma régional d'éducation pour la santé (SREPS), le Plan régional de santé publique (PRSP) et bientôt le Projet Régional de Santé (PRS), le Plan régional santé environnement (PRSE), et la Conférence régionale de santé et de l'autonomie (CRSA). Les chargés de projets de l'Ireps sont présents dans les commissions régionales soit à titre de conseil, d'expertise ou même d'animation et de coordination comme c'est le cas pour la commission régionale nutrition santé ou la commission régionale du vieillissement.
De par leurs missions auprès du Conseil régional, les chargés de projet de l'Ireps font un lien entre les programmes prioritaires du Conseil régional pour la santé des jeunes de 15 à 25 ans et le programme enfants jeunes adultes du PRSP.

Cette connaissance des programmes et cette expertise croisée sont une garantie d'efficacité dans l'appui méthodologique aux porteurs de projets. De plus, les comités départementaux d'éducation pour la santé, opérateurs territoriaux de l'Ireps, participent aux Comités territoriaux de santé publique dans leur département (bientôt antennes territoriales de l'ARS). Ceci garantit une meilleure efficacité des réponses apportées aux services de l'Etat à l'échelon régional comme à l'échelon départemental.

Une convention d'objectifs et de moyens a été signée entre le Groupement régional de santé publique du Languedoc-Roussillon et l'Ireps. Elle fixe les modalités de mise en oeuvre des missions de base de l'Ireps en référence au SREPS qui a pour ambition de mettre en place une véritable mission de service public dans le domaine de la prévention et de l'éducation pour la santé.
De plus, l'Ireps met en oeuvre certains programmes qui proposent un appui aux politiques publiques.
C'est le cas des programmes suivants :


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